一些动物粪便如猪牛栏肥以及人粪尿未经发酵腐熟直接施入土壤,这些未充分发酵腐熟的有机肥在土壤中经微生物分解发酵,产生的氨气容易引发作物烧根、中毒,有的还会滋生杂草和传播病虫害。因此,应提倡将其充分发酵后施用,提倡在田边地头建贮粪池发酵的方法,或者将堆肥堆积加水湿润,用泥封住,使其温度达到35~40℃,经过25~30天即可发酵完毕,高温法将粪肥在60℃条件下充分发酵,可杀灭其内的虫卵和杂草种子,使用时更安全。

(图:利用翻堆机堆肥发酵有机肥)
在一些地方习惯将有机肥料如猪牛栏粪肥,在太阳下晒干,或者施在旱土作物表土上,这样做的结果是让粪肥长期日晒雨淋,氮素基本上挥发损失掉了,速效磷钾也会大半流失,而且污染环境。有的地方在采用秸秆还田作有机肥源时,因发酵腐烂不充分,又过于集中施用稻株行间,结果是在腐烂中产生大量硫化氢,多有气泡冒出,使稻根变黑,禾苗迟发,不及时补救会使全田出现僵苗,引起减产。遇到这种情况,应排水晒田,在排水晒田后及早喷施复硝酚钠等促进根系生长的生长调节剂,并加1%磷酸二氢钾和1%尿素混合喷雾,可较好恢复正常生长。